瓶装啤酒的“冷芯”实验表明，在快速加热瓶装啤酒时，不可能均匀地加热瓶中的啤酒。热交换是通过传热性能较差的玻璃表面进行的。要开始加热，首先要加热瓶子的外面，但里面的啤酒仍然是冷的。只要瓶子最冷部分的冷芯温度不升高，也可以加热到所需的杀菌温度，达到规定的巴氏杀菌单元。否则不能完成整瓶的加热。冷芯位于瓶底向上 1.5 米处。
巴氏杀菌的测量点和记录受到温度处理的限制，这会在瓶子内产生流动截面，导致容器内各个点的温度分布和灭菌单位不一致。为此，采用容器内部的两个基准点来测量表观杀伤面单元，该单位位于容器的中轴线和容器底部1/3的高度上。第二个是最低温度点，位于容器的中心轴，距离底部8~10mm。由于该侧点基本上不受容器内部流动的影响，加热时该点的温度最低。这样就可以通过带有测温点的瓶子准确测量杀菌机各温度区的温度。具体方法是将测得的瓶装酒放入仪器中，放入杀菌机，其他瓶酒通过杀菌机，杀菌后取出仪器记录，直接从记录中得到PU值桌子。现代巴氏杀菌机使用计算机和显示器来监控巴氏杀菌温度。他们记录了每个温区的最高温度、瓶子中的实际温度以及实际达到的巴氏杀菌单位。
隧道灭菌器温度的精确控制极为重要，一方面要实现瓶子的彻底灭菌；另一方面，尽量减少水和热能的消耗。

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